《因明入正理论疏》六卷(通行刊本八卷)，唐窥基撰。窥基(632～682)系元魏时尉迟部的后裔，十七岁时依止玄奘出家，经过了十一年，参加译经，编纂《成唯识论》，并深入研究了因明。但到玄奘去世，乾封元年(666)后，他才作《因明入正理论》的注疏，迄于晚年还未写定，在解释喻过"能立不成"处便中止了，以下各段，还是他的门人慧沼继续完成的。

　　《因明入正理论》，一卷，商羯罗主造，是玄奘从事译经的第三年，即贞观二十一年(647)中所译。因明这一种学问在当时是极觉新鲜的，所以奘门竞行学习。过了一年，玄奘又译出《因明正理门论》(一卷，陈那造)，充实了研究的资料，于是其时著名的神泰、靖迈、明觉三家的《入正理论疏》便在永徽初年间(650～652)撰成了，接着又有文轨、玄应、文备、璧公诸师的注解。这些注书各记所闻，并参照《理门论》加以发挥，一时颇为流行。窥基的《论疏》就是在这些著述基础上，抉择取舍而写成的。

　　基《疏》内容，于解释《入论》本文之前，有短短的序论三段(本疏卷一)：一、叙所因，略述因明的源流，世亲、陈那的著作，本论的缘起，并说到玄奘在赴印途中迦湿弥罗国僧称论师处开始学习了本论，后在那烂陀寺戒贤门下更穷尽了幽微，回国不久便译出了本论。二、解论名，采取了当时神泰、文备、文轨、靖迈四家之说，加上他自己的见解，一共五释，未予轩轾。但据其最后所解，以正理指陈那的著作(特别是《理门论》)而言，似乎更为当理。本段末尾还解说了本论作者商羯罗主得名的由来，可惜未详其身世。三、明妨难，解释对于因明这一名称的七种疑难，大都是当时存在的异论。

　　本疏解释论文，大分两段：第一大段解释论首总标纲领的摄颂以及随后详解的长行，第二大段解释论末显略指广的结颂。首段解释摄颂中对于所标出的八门(也就是八义：真似能立、真似能破、真似现量和比量)二益(也就是二悟：自悟、悟他)，都有简明扼要的说明，如说真能立是三支具足而且一无过失，真能破有显过和立量的不同，真现量是定心或散心之照符前境、明局自体，真比量是以共许因成立未许宗能生决定智等，无一非精粹之谈。随后还推论到瑜伽学系论书解说这些义门的沿革。

　　其次解释本论长行。因为本论结构还是依据《理门论》以立破为纲，故在真似能立之后接着就说真似二量(这是视二量为能立的工具，所以这样安排)，再说真似能破，一共六段，和摄颂的顺序不同。撰者体会这样的精神，在释文里也就偏详于立破。他解释真能立的一部分有不少精到的见解。如解三支比量的宗支处(本疏卷二初)，指出宗依(构成宗支的主词即"有法"和宾词即"能别"两个部分)与宗体(由能别解释有法所得的整个意义)之应严加区别。又宗体在四种悉檀(即普遍的、自宗的、旁推的、随意的)里应取第四随自意乐而建立，不受拘束。又解因支处(本疏卷二末)指出因有启发作用的生因和了解作用的了因，二者又各有言、义、智三方面(合成六因)，而就立量悟他来说，因支是应该以言生和智了二因为其实质的。又解喻支处(本疏卷三)，辨析到异喻用在止滥(即遮止因法通于宗的对立面)，无妨用无体之法为喻依。由此再推到三支之有体，无体，应当互相适应(立有体的宗，因喻俱应有体，立无体宗则不拘，见本疏卷四)。这些议论虽在其他论书里(如《广百论释》曾谈到因法的有体无体等)，旧疏里(如文轨的疏文曾谈到宗依、宗体和四悉檀等)，已见其端倪，而作出彻底详尽的发挥，则是此疏所独有。

　　就在这些释文里，此疏也随时纠正各家旧疏的错误。最显著的例子，即是本论之解释宗支，有一句译文是"极成能别差别性故"(意谓宗是由于双方共许的"能别"区别了……而成的)。文轨等旧疏却作"……差别为性"来解释，这不但违反因明的轨辙，又还不懂中印语文的规律，贻误学人，为害不浅，故撰者予以严厉的谴责而毫无宽假(见本疏卷二)。

　　其次，解释似能立一部分。此分从本论的结构来看，可说是最大特点之所在。因为陈那的著作《理门》、《集量》等论书里，虽已对于三支过失作了全面的说明，但文义比较散漫而隐晦，《入论》乃加以整理、明确，并有所补充(如宗过的后面四种)，于是厘然列出宗九过、因十四过、喻十过、而合成三十三过，又各各举了确切的范例，使人一目了然，可谓极其精采(后人学习因明的，也从研习三十三过而入，可谓"思过半矣"之效)。基疏对这部分的解释，尽了很大的努力，以篇幅言，几占现存全疏的一半(三卷有余)。他为了明确刊定每一种过失的特征与其可能运用的范围，作出种种的分析。如解各过，都举出全分的，一分的两类四句(此即以正面对自许、他许、共许而为三句，反面全非又为一句)，而刊定其是非(一、三句是过失，二、四句则不然)。另外又在各支过失可以兼备的方面，错综排列出所有的句式，以为真似的刊定。以宗过一类为例，九过互具，再加以全分、一分四句的分别，即可演绎出二千三百另四种句式(见本疏卷五)。这虽不免过于形式化，但从其可能性上，究极奥蕴，不得不说是基疏对于因明理论的一种发展。

　　即由于三支过失的刊定和所对而言者(自、他、共三方面)有关，基疏从这一点更推论到比量之运用于破他、自救，乃至于留防过地步等等，也可在三支上予加限制的言词(如只是自宗承认的加"自许"，他宗承认的加"汝执"，两家共认而非泛泛之谈则加"胜义"或"真故" 等)，提了出来，并不成为过失(在护法、清辨的著书里，此例极多)，这样就有了"自比量"、"他比量"、"共比量"的区别。又在共比量里，还可扩大因支的范围，加上自许或他许的部分，以成"自共比"或"他共比"，三支比量的运用乃益灵活而广泛。基疏对于这些用法，一再透辟地阐明其意义，并举出玄奘在印度时所立"唯识量"和改订的胜军"大乘是佛说"量来作为例子而详加解释，又对顺瞋的反对唯识量作了批判(见本疏卷五、卷六)。基疏在这一方面的发展，对于当时的佛学讲论、著述以及理解护法、清辨等论书，均有很大的实用意义。本疏原稿不全，只到解释喻过的开端为止，以下十种喻过、真似二量、真似能破各段，都付缺如，这是很可惜的。不过慧沼(650～714)依据本疏的精神，很好的替它补足了。特别是二量部分，疏文未及详说的，还另写了《二量章》收在《法苑义林章补缺》之内，极便于研究。慧沼这一部分补写的疏文，后来单行，即题名《因明入正理论续疏》(因为有人曾将《续疏》删成节本，后世也误会为窥基原作略疏，其《续疏》不过是添加细注而已，参照内学院校刊本《因明入正理论续疏》卷末校记)。此外，文轨旧疏解释似能破一段，曾引《理门论》中十四过类一段详细解释，也曾被后人误认为窥基手笔，改题为《因明理门十四过类疏》，刊本单行。

　　本疏内容极其丰富，几乎涉及因明全部的问题，因此通称为《大疏》。其书一出，所余同类章疏为之晦采，大半零落失传。在慈恩宗内，奉本疏为圭臬，备致推崇，更不待言。象慧沼，除作了《续疏》而外，还撰有《入正理论义断》三卷、《纂要》一卷，引申本疏之说。其后，智周 (668～723)更对本疏作了《略记》一卷、《前记》三卷、《后记》一卷(未全)，解释益加详细。又本疏从中唐时传到日本后，讲习极盛，著述亦多，其中还保存不少的唐人旧说足供研究。其流传后世的主要著述，有善珠的《因明论疏明灯钞》六卷、明诠的《因明大疏导》并《里书》九卷、藏俊的《因明大疏钞》四十一卷、良遍的《因明大疏私钞》三卷。此外，还有凤潭的《因明论疏瑞源记》八卷，征引该博，解释细致，尤为风行。又本疏解释因四相违过一段，素称难解，日人对此也特别研究，另作注书，著名之作有真兴的《因明四相违略私记》二卷、源信的《因明论疏四相违略注释》三卷等。